Avaliação rotineira de infecções, prevenção e controle de SARS-COV-2 em populações desiguais

Considerando os diferentes contextos sociais e vulnerabilidades da população brasileira,  este projeto nasce do Icoda (International COVID-19 Data Alliance) e os Grand Challenges. Ambos lançaram a nova iniciativa piloto do Grand Challenges ICODA COVID-19 Data Science com o objetivo de abordar as principais questões sobre como reduzir os danos do Covid-19 e futuras pandemias.

Dentro desse contexto o projeto Avaliação Rotineira de Infecções, Prevenção e Controle de Sars-Cov-2 em Populações Desiguais tem como objetivo fornecer resultados visualizáveis por meio de plataformas de disseminação científica que podem ser atualizados em tempo real e aplicados para avaliar intervenções. Este estudo lida mais especificamente com as intervenções não farmacêuticas e a vacinação, a fim de minimizar a propagação viral e mitigar seus efeitos sobre a crise econômica que acompanhou este desafio sanitário e representa um problema particularmente mais difícil em economias emergentes que não podem recorrer a estratégias de resgate que dependem de gastos públicos para reativar as economias.

Objetivos

Geral: 

Nosso objetivo principal foi realizar modelagem matemática e estatística da dinâmica da epidemia de Covid-19 no Brasil para produzir um mapa de risco da evolução da doença e analisar estratégias de intervenções não farmacêuticas simultâneas e vacinação, considerando as disparidades socioeconômicas da população brasileira. Nosso formalismo se baseia em dados coletados sobre o status infeccioso individual, fatores socioeconômicos e de comportamento humano.  Dessa forma, visamos incorporar nossos resultados em uma plataforma de visualização e análise de dados com uma interface amigável que irá disseminar o trabalho. A plataforma permitirá que pesquisadores e formuladores de políticas tenham acesso ao impacto de uma ampla gama de intervenções combinadas em sua área de interesse: Pamepi.

Específico: 

1. Integração e visualização do fluxo de trabalho de dados: Esta etapa consiste em projetar uma expansão da plataforma de modelagem em andamento (https://modelacovid19.rondonia.fiocruz.br/shiny/covidApp/) para integrar e harmonizar os dados disponíveis propostos neste projeto e projetar como incorporar o risco espaço-temporal da transmissão do SARS-COV-2 e estratégias de modelagem para mitigar a propagação da doença
2.  Modelagem estatística e matemática básica:2.1 Desenvolver um formalismo matemático para a previsão de cenários de casos e mortalidade por infecções por Covid-19 que priorizem esquemas de vacinação concomitante a intervenções não farmacêuticas, levando em consideração a heterogeneidade de disponibilidade de recursos e condições socioeconômicas da população;2.2 Estimar o risco espaço-temporal da doença por meio de modelos lineares espaciais generalizados sob a abordagem bayesiana.
3. Plataforma de vigilância: nesta última etapa, pretendemos incorporar na plataforma analítica (que é um trabalho em andamento https://modelacovid19.rondonia.fiocruz.br/shiny/covidApp/) um esquema que possa ser atualizado instantaneamente para demonstrar áreas de risco e cenários simulados afetados pela heterogeneidade na disponibilidade de recursos e nas condições socioeconômicas. O produto permitirá que pesquisadores, legisladores e a ampla população acompanhem as mudanças dinâmicas da doença e entendam de forma interativa o impacto das intervenções direcionadas.

Em todas as etapas descritas anteriormente, documentações, relatórios, reuniões/webinars e submissão dos resultados em periódicos com revisão por pares serão produzidos concomitantemente para garantir a disseminação e reprodutibilidade de nossos resultados.