O Cidacs realiza estudos e pesquisas, em projetos interdisciplinares originados na análise de grande volume de dados, no âmbito das suas seis plataformas: Coorte de 100 Milhões de Brasileiros; Plataforma Zika; Tecnologias e Inovações para o SUS; Equidade e Sustentabilidade Urbana; Bioinformática e Epidemiologia Genética (Epigen).
As pesquisas desenvolvidas no Cidacs utilizam, principalmente, a vinculação de bancos de dados governamentais para gerar conhecimentos inovadores. Para tanto, os dados cedidos para o Centro são recebidos, armazenados e preservados com base em procedimentos de Curadoria Digital. Esses dados são processados em um ambiente computacional de alto desempenho, constituído pelo supercomputador Omolú e outros clusters computacionais situados no Centro de Supercomputação do Senai-Cimatec. Os dados abrigados no Omolú são acessados através de um ambiente monitorado, sem conexão à internet, com protocolos de segurança e controles de acesso restritos.